Aufgepasst! Captain Olimar mischt dieses Mal mit! Ihm zur Seite stehen fünf Arten von Pikmin! Er pflückt Pikmin aus dem Boden, wonach sie tapfer an seiner Seite kämpfen.

Ohne seine Pikmin ist Olimar aber aufgeschmissen, da er dann nicht mal einen Smash-Angriff ausführen kann. Es hilft ihm auch nicht besonders, dass die kurzlebigen Pikmin dazu tendieren, sich ohne seine Erlaubnis zu entfernen. Ihre Schicksale sind miteinander verbunden, ob sie es wollen oder nicht.